VASP 学习教程
太原理工大学 量子化学课题组
2012/5/25 太原


第一章 Linux命令
1.1 常用命令
1.1.1 浏览目录
cd: 进入某个目录。如：cd /home/songluzhi/vasp/CH4
    cd .. 上一层目录；cd / 经典mv根目录；
ls: 显示目录下的文件。
注：输入目录名时，可只输入前3个字母，按Tab键补全。
1.1.2 浏览文件
cat：显示文件内容。如：cat INCAR
如果文件较大，可用：cat INCAR | more  (可以按上下键查看)
合并文件：cat A B > C (A和B的内容合并，A在前，B在后)
1.1.3 目录操作
mkdir：建立目录；rmdir：删除目录。
如：mkdir T-CH3-Rh111
1.1.4 文件操作
rm：删除文件；vi：编辑文件；cp：拷贝文件
mv：移动文件；pwd：显示当前路径。
如： rm INCAR      rm a* (删除以a开头的所有文件)
rm -rf abc (强制删除文件abc)
tar：解压缩文件。压缩文件？？rar
1.1.5 系统信息
df：分区占用大小。如：df -h
du：各级目录的大小。
top：运行的任务。
ps ax：查看详细任务。
kill：杀死任务。如：kill 12058 （杀死PID为12058的任务）
注：PID为top命令的第一列数字。
第二章 SSH软件使用
2.1 软件界面
SSH界面
SSH transfer
2.2 SSH transfer的应用
2.2.1 文件传输
从本地文件中，把所需的计算文件直接拖到服务器中。一般就是VASP计算的四个文件INCA
R，KPOINTS，POSCAR，POTCAR。
2.2.2 简单应用
在右侧文件夹中可以直接构建文件夹，删除文件，修改文件。
从SSH要cd到某个文件夹下时，可先从SSH transfer进入，直接复制路径栏，可快速进入。
第三章 VASP的四个输入文件
3.1 INCAR
SYSTEM = name
ENCUT = 400
PREC = Medium
EDIFF = 5E-4
EDIFFG = -0.1
GGA = 91
VOSKWN = 1              ! 磁性计算
ISYM = 0                  ! 对称 0 无 1 有
LREAL = .FALSE.          ! 倒空间
ISPIN = 2                  ! 2 磁性计算 1 不进行
ISTART = 0                ! 0初次计算，  1再次计算
ICHARG = 2                ! 2构造原子密度
ISMEAR = 2                ! -5 半导体；DOS 静态计算 0；原胞较大，k点小于4，单个原子，小分子；1 2金属体系。
SIGMA = 0.1
IBRION = 2                ! 1 DIIS,  2 CG, 5 频率，3 过渡态
ISIF = 2                    ! 2 结构优化， 3 晶胞优化
NSW = 200                ! 离子运动步数
POTIM = 0.05              ! 步长
NELMIN = 4                ! 最小迭代次数
NELM = 200                ! 最多迭代次数
LWAVE = .FALSE.          ! 不输出波函数
LCHARG = .FALSE.        ! 不输出密度函数
3.2 KPOINTS
对于表面
surface
0
M
5 5 1
0 0 0
对于分子和原子
atom or molcular
1
Rec
0 0 0 1
3.3 POSCAR
CH4在Co100表面Top位的吸附      !(名称)
1.0
        5.0120000839        0.0000000000        0.0000000000